Autor
Tipo: Nome: Curso:
Aluno RAQUEL OLIVEIRA SILVA CIENCIAS BIOLOGICAS/DIURNO
Inscrição UFMG: Bolsa: E-Mail: Telefone:
2006026563 SEM BOLSA 35643202
Coordenador/Orientador
Nome: Unidade:
PATRICIA SILVA CISALPINO Instituto Ciências Biológicas
Inscrição UFMG: E-Mail: Telefone:
093483 pscisalp@icb.ufmg.br 34092754
Co-Autores
Nome: Curso: Tipo: Bolsa:
MARCO AURÉLIO SOARES MICROBIOLOGIA /D Aluno SEM BOLSA
Nome: Curso: Tipo: Bolsa:
AGLAUPE MOREIRA AGUIAR DO CARMO UNI-BH Externo SEM BOLSA
Nome: Curso: Tipo: Bolsa:
RUIZ, J.C René Rachou Externo SEM BOLSA
Dados do Trabalho
Título:
PROJETO ACADÊMICO-21 Caracterização estrutural e filogenia de um elemento retrotransponível da superfamília Copia presente no genoma do fungo patogênico Paracoccidioides brasiliensis
Área:
Ciências Biológicas
Resumo:
Retrotransposons são elementos móveis semelhantes aos retrovírus em sua estrutura e ciclo de vida. O processo de transposição nos genomas hospedeiros ocorre com a transcrição do elemento em uma molécula de RNA. Esta molécula sofre transcrição reversa em DNA pela enzima transcriptase reversa codificada pelo elemento. A nova cópia é, então, inserida no genoma hospedeiro numa nova localização levando ao aumento do número de cópias do retrotransposon. Dessa forma esses elementos promovem uma significativa contribuição no tamanho, organização e diversidade genética do genoma hospedeiro. Não existem trabalhos relatando a caracterização de elementos retrotransponíveis no genoma de P. brasiliensis. O objetivo deste trabalho foi caracterizar in silico um elemento retrotransponível da superfamília Copia no genoma de P. brasiliensis e verificar o grau de similaridade com outros elementos descritos em outras espécies. A metodologia utilizada envolveu a criação e a aplicação de um pipeline no qual vários programas computacionais foram empregados, tais como:  ORF-FINDER, ARTEMIS, LTR-FINDER, MEGA4, etc. O elemento caracterizado recebeu nome de PaSret, apresentou tamanho de 5183pb, possui ORFs correspondentes à transcriptase reversa, integrase e RNAse H  flanqueadas por sequências diretas repetidas de 103pb (Long Terminal Repeats ou LTRs). A comparação com outros elementos permitiu agrupá-lo dentro do grupo de elementos da superfamília Copia. O pipeline criado permitiu a execução das análises de forma rápida e ordenada, facilitando a busca e o manuseio das sequências.  
Palavras-Chave:
Elementos retrotransponíveis, Paracoccidioides brasiliensis
Instituições:
CNPq, Fiocruz