O acervo arquivístico do Museu de História Natural e Jardim Botânico (MHNJB) é composto por documentos provindos de duas origens: a primeira formada por coleções de documentos pessoais adquiridos pelo Museu relacionados ao acervo museológico recebidos pelo MHNJB por doação; e a segunda, por coleções de documentos institucionais produzidos e acumulados no decorrer das atividades do MHNJB, que constitui o seu arquivo institucional.