O Museu possui duas portarias de acesso.
A Portaria 1 dá acesso à trilha principal, cujo percurso dura aproximadamente 15 minutos e passa por árvores notáveis, como a sapucaia e o jequitibá.
A Portaria 2 é de acesso exclusivo para pedestres e leva direto à área de exposições. É a portaria mais próxima do Presépio do Pipiripau.
Nos pontos indicados no mapa, passam os ônibus das linhas 4802A, 8001A, 9105, 9402, 9414, 9550, 4600 e 7980.
Próximo à Portaria 2 está também a estação Santa Inês do metrô.
O Museu fica na rua Gustavo da Silveira, 1035, bairro Santa Inês.
A entrada é gratuita.
