O Programa Educação Ambiental e Patrimonial do MHNJB (PEAP) relaciona-se com os conceitos geradores da instituição, abordando tanto as temáticas da bio e da geodiversidade, como o rico acervo cultural do MHNJB que compreende as heranças e os testemunhos materiais e imateriais, históricos e pré-históricos da vida e do homem. Aborda também a percepção ambiental e a saúde humana. Este programa compreende projetos e ações que tem como objetivo difundir, popularizar e divulgar os conhecimentos científicos construídos principalmente no âmbito da instituição, bem como cumprir com a missão institucional, de formação de pessoal e atendimento ao público. Várias atividades são realizadas com o objetivo de proporcionar experiências de fruição do patrimônio natural e das coleções do MHNJB, além de oportunidades de apropriação do conhecimento científico, historicamente acumulado, sobre a história natural do planeta e, em particular, do território de Minas Gerais. Esse trabalho de extensão que se apóia em atividades de ensino e de pesquisa, desenvolvidas no âmbito da Universidade e do MHNJB, é realizado por intermédio de uma equipe de professores e funcionários técnico-administrativos, e da participação significativa de estudantes de cursos de graduação da UFMG.